上海應物所等實(shí)現原子力顯微鏡下DNA直讀檢測

上海應物所等實(shí)現原子力顯微鏡下DNA直讀檢測

   近日，中國科學(xué)院上海應用物理研究所物理生物學(xué)研究室與上海交通大學(xué)、南京郵電大學(xué)合作，基于DNA納米技術(shù)發(fā)展了一系列DNA折紙結構并作為納米力學(xué)成像探針，實(shí)現了原子力顯微鏡下對基因組DNA的直讀檢測和高分辨成像。相關(guān)結果發(fā)表于《自然-通訊》（Nature Communications2017,8,14738）。

上海應物所等在DNA折紙納米力學(xué)成像探針設計方面取得進(jìn)展

　　DNA折紙結構是利用DNA堿基互補配對原則，通過(guò)程序性設計將M13 DNA在上百條DNA短鏈的輔助下折疊成指定幾何形狀。上海應物所博士張宏陸等在研究員樊春海指導下，并與晁潔、師詠勇等合作，通過(guò)設計DNA折紙結構作為原子力顯微鏡的納米力學(xué)成像探針，在單分子水平下實(shí)現了對DNA分子的特異性標記和單核苷酸變異性（SNP）的直讀檢測。

　　相較于基于熒光成像的直讀方法，這種新技術(shù)將分辨率提升一個(gè)數量級，可達到遠超光學(xué)衍射極限的10納米分辨。基于DNA納米折紙結構設計的探針為原子力顯微鏡的圖像獲取提供了精確的標尺和豐富的選擇，為遺傳分析等生物學(xué)應用提供了新的工具。進(jìn)一步，他們還將該方法與之前發(fā)展的納米PCR和單倍型分析技術(shù)(Nature Nanotechnology 2011,6,639)結合，實(shí)現了單分子水平的遺傳樣本單倍型分析。這種單分子水平的單倍型分析通量高，可靠性好，有望用于易感基因的發(fā)現、疾病相關(guān)基因的鑒定和藥物設計等方面。

編輯點(diǎn)評

　　中國科學(xué)院上海應用物理研究所物理生物學(xué)研究室納米力學(xué)成像探針，成功實(shí)現了原子力顯微鏡下對基因組DNA的直讀檢測和高分辨成像，有望用于易感基因的發(fā)現、疾病相關(guān)基因的鑒定和藥物設計等方面

　　（原標題：上海應物所等在DNA折紙納米力學(xué)成像探針設計方面取得進(jìn)展）

（來(lái)源：上海應用物理研究所）

文章鏈接：中國化工儀器網(wǎng) http://www.chem17.com/news/detail/111152.html